Ebbe due mogli: nel 1786 sposò Giustina Grifoni, erede di uno dei rami della famiglia. Rimasto vedovo nel 1792, si risposò due anni dopo con Maria Maddalena Martelli. Dalla prima moglie ebbe una figlia, Giulia (1787-1829), da Maria Maddalena Martelli ebbe Teresa (1796-1862), Luisa (1796-1845). Lorenzo, Antonio (1799-1815) e Gaetano (1801-1806). Giuseppe si impegnò in azzardate speculazioni finanziarie durante il periodo napoleonico, indebitando in modo consistente la parte del patrimonio Niccolini ereditata dal padre.

Titoli Onorifici : 8° marchese